авторефераты диссертаций БЕСПЛАТНАЯ  БИБЛИОТЕКА

АВТОРЕФЕРАТЫ КАНДИДАТСКИХ, ДОКТОРСКИХ ДИССЕРТАЦИЙ

<< ГЛАВНАЯ
АГРОИНЖЕНЕРИЯ
АСТРОНОМИЯ
БЕЗОПАСНОСТЬ
БИОЛОГИЯ
ЗЕМЛЯ
ИНФОРМАТИКА
ИСКУССТВОВЕДЕНИЕ
ИСТОРИЯ
КУЛЬТУРОЛОГИЯ
МАШИНОСТРОЕНИЕ
МЕДИЦИНА
МЕТАЛЛУРГИЯ
МЕХАНИКА
ПЕДАГОГИКА
ПОЛИТИКА
ПРИБОРОСТРОЕНИЕ
ПРОДОВОЛЬСТВИЕ
ПСИХОЛОГИЯ
РАДИОТЕХНИКА
СЕЛЬСКОЕ ХОЗЯЙСТВО
СОЦИОЛОГИЯ
СТРОИТЕЛЬСТВО
ТЕХНИЧЕСКИЕ НАУКИ
ТРАНСПОРТ
ФАРМАЦЕВТИКА
ФИЗИКА
ФИЗИОЛОГИЯ
ФИЛОЛОГИЯ
ФИЛОСОФИЯ
ХИМИЯ
ЭКОНОМИКА
ЭЛЕКТРОТЕХНИКА
ЭНЕРГЕТИКА
ЮРИСПРУДЕНЦИЯ
ЯЗЫКОЗНАНИЕ
РАЗНОЕ
КОНТАКТЫ

Pages:     | 1 ||

Грибы в коллекциях культур: фундаментальные и прикладные аспекты

-- [ Страница 2 ] --

Таблица 10 - Условные обозначения методов хранения и консервации Пересев на питательных средах С-4 Субкультивирование аэробное на скошенном агаре С-5 Субкультивирование на скошенном агаре под вазелиновым маслом С-8 Субкультивирование на скошенном агаре под водопроводной водой Высушивание В-4 Высушивание спор в почве Лиофилизация Л-1 Лиофилизация в сепарированном молоке Криоконсервация Криоконсервация в глицерине при - 196С с высокой* скоростью К- охлаждения К-5 Криоконсервация при - 196С с низкой** скоростью охлаждения К-7 Криоконсервация на силикагеле – 70С, -150С К-8 Криоконсервация при -70С Примечание * высокая скорость охлаждения – около 400/мин ** низкая скорость охлаждения – 1/мин Таблица 11 - Методы хранения разных таксономических групп фонда грибов ВКМ Методы хранения Царство Подцарство Класс Стадия К-1, B-4 Л-1 К- C-4 C- К-5, К- Chromista Oomycota Oomycetes + + + Fungi Zygomycota Zygomycetes + + + + + ам Fungi Ascomycota Ascomycetes + + + + + тм Fungi Ascomycota Ascomycetes + + + + + ам Fungi Ascomycota Saccharomycetes + + + + + тм Fungi Ascomycota Saccharomycetes + + + + тм Fungi Ascomycota Taphrinomycetes + + + ам Fungi Basidiomycota Basidiomycetes + + + + тм Fungi Basidiomycota Basidiomycetes + + + тм Fungi Basidiomycota Urediniomycetes + + + ам Fungi Basidiomycota Ustilaginomycetes + + + + тм Fungi Basidiomycota Ustilaginomycetes + + + Метод лиофилизации используется для поддержания жизнеспособности около 80% (2991 штамм, относящийся к 1010 видам и 303 родам) фонда мицелиальных грибов ВКМ. Представители различных таксономических групп (Zygomycetes, Ascomycetes – телео- и анаморфы), формирующие в чистой культуре различные типы покоящихся структур (споры, склероции и т.д.), в целом достаточно хорошо переносят условия лиофилизации. По нашим данным от 87 до 92% этих штаммов сохраняют жизнеспособность после лиофилизации. При этом для 40% всех лиофильно высушенных культур были получены положительные результаты хранения при 5°С не менее 20 лет, а культуры более 130 видов сохранили жизнеспособность после 30-38 лет хранения. Вместе с тем, выявлены виды, представители которых даже при наличии обильного спороношения теряют жизнеспособность в процессе лиофилизации. К таким видам относятся, в частности, Conidiobolus coronatus, C. obscurus (syn. Entomophthora thaxteriana), C. thromboides (syn. Entomophthora virulenta), Erynia conica (syn.

Entomophthora conica), Pandora dipterigena (syn. Entomophthora dipterigena), Cunninghamella homothallica, C. vesiculosa. Довольно быстро после лиофилизации (менее 10 лет) утрачивают жизнеспособность и представители рода Botrytis (B. cinerea, В. fabae и B. gladiolorum), образующие в культуре в качестве покоящихся форм только склероции.

Для неспорулирующих организмов из классов Oomycetes и Basidiomycetes метод лиофилизации в ВКМ не используется в связи с тем, что стерильный мицелий в целом не выдерживает процесса лиофилизации. В литературе, однако, имеется информация о создании специального протокола для успешной лиофилизации стерильного мицелия некоторых эктомикоризных грибов, в частности Laccaria laccata. Необходимым условием такого процесса является предварительное медленное замораживание материала до температуры -32°С (Sundari, Adholeya, 1999).

Криоконсервация. Согласно данным литературы, замораживание ультрабыстрым способом и последующее хранение в жидком азоте при –196С позволяет гарантированно сохранять значительную часть культур грибов в течение длительного времени (Ryan, Smith, 2007). Однако способность противостоять повреждающим факторам в процессе замораживания-оттаивания значительно различается у разных видов и зависит от индивидуальных особенностей организмов (наличия и типа спорообразования, состава цитоплазматической мембраны и клеточной стенки в целом, физиологического состояния организма и др.). Подбор оптимальных криопротекторов, а также режимов (скоростей) замораживания и оттаивания позволяет увеличить число и разнообразие таксонов, сохраняемых методом криоконсервации (Smith, Thomas, 1998).

В ВКМ данный метод начал использоваться с середины 80-х годов XX века. В настоящее время более 70% фонда грибов (2714 штаммов, относящихся к 1148 видам и 405 родам) заложено на хранение с использованием различных программ криоконсервации. Низкотемпературное замораживание проводится в защитных средах с оптимальной для каждой культуры скоростью охлаждения. При наличии хорошего бесполого или полового спороношения применяли, как правило, ультрабыстрый метод охлаждения с последующим хранением в жидком азоте или в низкотемпературном холодильнике.

В процессе подбора и оптимизации методов хранения культур разных групп мицелиальных грибов ВКМ было проанализировано влияние различных факторов на длительность сохранения их жизнеспособности. Полученные данные свидетельствуют не только о необходимости поиска новых модификаций метода криоконсервации мицелиальных грибов, но и о целесообразности периодической (с частотой не менее в 7 10 лет) проверки их сохранности для последующего анализа и систематизации данных с учетом таксономической принадлежности культур. В результате были предложены модификации метода криоконсервации, применимые для длительного гарантированного сохранения грибов, в том числе и труднокультивируемых (таблица 12). Особое значение данных модификаций заключается в возможности их использования в отсутствии дорогостоящего оборудования (программного замораживателя или азотного хранилища).

Таблица 12 – Модификации методов низкотемпературного замораживания Модификация Скорость охлаждения Температура хранения К-8 3/мин до -70С -70С К-14 -0,4/мин до -70С -70С -0,4/мин до -70С, затем К-15 -196С 400/мин Установлено, что ряд культур класса Zygomycetes, относящихся к родам Mortierella, Basidiobolus, Coemansia, Lobosporangium (syn. Echinosporangium) не сохраняет жизнеспособность при использовании ультрабыстрого охлаждения даже при наличии обильного бесполого спороношения. В данном случае положительный результат удалось получить при модификации режима криоконсервации – использовании программного замораживания. Этот же способ был использован для грибов, представленных в культуре мицелием без спороношения и плодовых тел или образующих зооспорангии (Oomycetes, Basidiomycetes). Показано, что через 20 лет хранения жизнеспособность сохраняют представители разных таксономических групп:

базидиомицеты – Pholiota adiposa, Heterobasidion annosum, Piptoporus betulinus, Chondrostereum purpureum, зигомицеты - Cunninghamella japonica, Basidiobolus meristosporus, аскомицеты – Chaetomium elatum, Thielavia terrestris и др. (таблица 13).

Анализ имеющихся в ВКМ данных показывает, что около 20% культур Oomycetes, 4% - Basidiomycetes, 1% - Zygomycetes, 1% - Ascomycetes не поддаются процессу криоконсервации даже с использованием всех известных режимов криоконсервации и их модификаций. По нашим данным, наибольшие проблемы при поддержании в коллекции связаны с сохранением жизнеспособности оомицетов, относящихся к родам Brevilegnia, Dictyuchus, Phytophthora, некоторых видов рода Achlya и Saprolegnia, а также культур, относящихся к классу Basidiomycetes (Suillus, Amanita, Dictyophora, Mutinus). При этом, чем дольше культура поддерживается в коллекции периодическими пересевами, тем хуже она переносит процедуру замораживания впоследствии.

Есть мнение, что если культуры микроорганизмов способны пережить сам процесс криоконсервации, то они в дальнейшем неограниченное время будут жизнеспособны (Ryan et al., 2000). Тем не менее, по нашим данным, некоторые штаммы грибов, относящиеся к видам Coemansia aciculifera, Mortierella humilis, Conidiobolus thromboides, потеряли способность к росту после 5-7 лет хранения в жидком азоте, несмотря на положительный результат через сутки после погружения в жидкий азот.

Однако, по-видимому, это скорее исключение из правил, так как результаты, полученные нами в данной работе, показали, что около 350 штаммов грибов разных таксонов, выборочно проверенных после 20 лет хранения, остались жизнеспособными.

Таблица 13 - Консервация мицелиальных грибов ВКМ с использованием модификаций метода низкотемпературного замораживания Число штаммов, заложенных по программам криоконсервации Таксоны ультрабыстрое медленное охлаждение общее охлаждение число К-1 К-8 К-5 К-14 К- штаммы 519 370 209 61 64 Z виды 157 132 76 41 40 Zygomycetes роды 39 30 26 12 7 штаммы 70 - - 47 24 виды Oomycetes 42 - - 32 19 роды 8 - - 7 4 штаммы 1434 887 537 220 28 Anamorphic виды 678 476 292 170 24 fungi роды 205 148 126 88 20 штаммы 260 172 53 37 - виды Ascomycetes 130 98 10 32 - роды 59 49 9 19 - штаммы 355 - 142 147 109 виды Basidiomycetes 174 - 85 84 83 роды 103 - 57 56 60 Всего штаммов 2638 1429 941 512 225 Представленный в диссертации анализ результатов по подбору и оптимизации современных методов консервации штаммов мицелиальных грибов различных таксономических групп может быть полезен широкому кругу специалистов, в той или иной степени занимающихся вопросами поддержания и исследования данной группы эукариотных микроорганизмов. В качестве справочного материала могут быть использованы сведения по длительности сохранения жизнеспособности штаммов разных видов грибов, представленные в приложениях 4 и 5 к диссертации.

Глава 5 Прикладное значение коллекционных штаммов мицелиальных грибов С целью повышения эффективности разработок в области биотехнологии, все более актуальным становится получение информации о потенциальных продуцентах, связанной как с конкретными видами и штаммами, так и с отдельными направлениями биотехнологически перспективных поисковых работ. Особое значение при этом имеет наличие в архиве коллекции информации по отдельным штаммам. Это не только данные о том, откуда и когда была получена та или иная культура, но и описание тех свойств, которые были найдены за всю историю существования конкретного штамма и, конечно, ссылки на литературные данные. Накопление сведений по штаммам в коллекции ведется в специализированных базах данных с использованием отечественной и зарубежной периодики, а также патентной информации и различных доступных баз данных. Большое значение для этого имеет взаимодействие ВКМ с международной информационной системой StrainInfo (www.straininfo.net).

Частично информация о свойствах поддерживаемых штаммов отображена в каталоге ВКМ, где указаны ссылки на опубликованные работы, связанные с определенными номерами культур. Однако объем каталога обычно ограничен и не позволяет привести все имеющиеся в коллекции сведения. В связи с этим представленный в данной работе материал о конкретных свойствах, имеющихся в ВКМ культур мицелиальных грибов, может быть интересен для выбора объектов исследования, обладающих потенциальной активностью, с целью планирования последующих биотехнологических разработок. Из выборочных данных архива ВКМ, представленных в диссертации, видно, что среди грибов ВКМ есть продуценты ферментов, органических кислот, алкалоидов и других биологически-активных веществ, есть штаммы, давно известные своей способностью к активной деградации целлюлозы, лигнина и других субстратов, также как и к трансформации различных органических соединений. Все эти культуры могут использоваться в прикладных поисковых исследованиях для получения различных биологических препаратов. Информация о свойствах отдельных штаммов ВКМ постоянно накапливается, чему способствует введенное в редакциях некоторых научных журналов правило для авторов указывать в их публикациях коллекционные номера использованных исследователями культур.

Полученные данные позволили представить разнообразие свойств имеющихся штаммов мицелиальных грибов фонда ВКМ по различным группам (рисунок 24).

Биотехнологический потенциал поддерживаемых штаммов микроорганизмов может быть оценен с помощью анализа существующих в коллекциях культур баз данных об их свойствах. При этом большое значение для научных и научно-прикладных исследований имеет возможность доступа к чистым культурам определенных таксонов, для которых известна способность к биосинтезу конкретных органических веществ. В связи с этим, был проведен анализ поддерживаемых в ВКМ штаммов грибов рода Penicillium, для которых показана способность к синтезу метаболитов различной химической природы.

Биологическая Биологическая добавка к пище очистка сточных Ферменты вод Использование в Продуценты селекции растений Белки Определение Липиды и жирные грибостойкости кислоты Деструкция и трансформация Полисахариды Сорбенты Алкалоиды Другие вещества Антогонисти ческие свойства Рисунок 24 – Свойства штаммов фонда грибов ВКМ В настоящее время фонд ВКМ насчитывает 641 штамм рода Penicillium, относящихся к 122 видам. Из них 482 культуры представлены в каталоге ВКМ, доступном on-line (www.vkm.ru) и активно выдаются пользователям по их запросам.

Значительная часть недавно выделенных штаммов данного рода составляет рабочую коллекцию ВКМ, созданную в процессе изучения биологического разнообразия грибов многолетней мерзлоты Арктики и Антарктиды или выделенных из различных других уникальных природных и техногенных субстратов. База данных ВКМ по разнообразию метаболитов грибов рода Penicillium охватывает 160 видов данного рода, среди которых найдены продуценты 395 органических веществ. Объем базы данных насчитывает в настоящее время 1918 записей. Информация структурирована по следующим полям:

•название класса соединений, •название органического вещества, •название вида гриба, для которого известно данное свойство, •номер штамма ВКМ данного вида, •использование метаболита в качестве диагностического признака в идентификационных ключах по роду Penicillium, •возможное прикладное значение метаболита, •литературные источники. Дальнейшее развитие базы данных позволяет включение полей с новыми категориями информации.

В результате проведенного анализа данных опубликованных в литературе в течение последних 30 лет впервые представлена сводная информация о 175 штаммах видов и вариантов рода Penicillium, поддерживаемых в ВКМ, обладающих способностью к биосинтезу вторичных метаболитов: P. aurantiogriseum, P. brevicompactum, P. camemberti, P. canescens, P. chrysogenum, P. citreonigrum, P. citrinum, P. commune, P. decumbens, P. dierckxii, P. expansum, P. granulatum, P. griseofulvum, P. islandicum, P. janczewskii, P. jensenii, P. melinii, P. miczynskii, P. oxalicum, P. palitans, P. phoeniceum, P. purpurogenum, P. roqueforti, P. rugulosum, P. simplicissimum, P. solitum var. solitum, P. solitum var. crustosum, P. variabile, P. verrucosum, P. vitale, P. vulpinum, P. waksmanii. Представители данных таксонов обладают способностью к синтезу 116-ти метаболитов, относящихся к различным классам соединений, таким как бензодиазепиновые (аурантин, циклопенин, циклопенол, циклопептин, 6-гидрокси-2-метилбензоидная кислота), дикетопиперазиновые ( метаболита, в том числе веррукозин, виридикатин, рокефортин и их производные, метаболиты PF, бревианамиды A и В, гландиколины A и В, дикетопиперазин, мелеагрин, оксалин, пискаринины А и B, пуберулин, ругулозувины A и В, феллутанины, эргостерол и др.), клавиновые (33 метаболита, в том числе агроклавин, ругуловазин, фумигаклавин, ханоклавин и их производные, аурантиоклавин, костаклавин, пенниклавин, пироклавин, ЦПК, элимоклавин, эпикостаклавин и др.), хинолиновые алкалоиды (хиноцитринины А и В, 3-метоксивиридикатин), поликетиды ( метаболитов, в том числе 6-метилсалициловая кислота, виомеллеин, гризеофульвин, дехлоргризеофульвин, изопатулин, ксантомегнин, микофеноловая кислота, охратоксин, патулин, пеницилловая кислота, симатоксин, фульвиевая кислота, циклохлоротин, цитринин,, производные аминокислот, и др.), производные аминокислот (тремортины, N-ацетилтриптотамин, ИУК), терпены (PR-токсин), метаболиты с неустановленной природой (фоеницин, эстин, лютеоскирин).

Разработка базы данных по метаболитам грибов рода Penicillium позволила использовать ее в качестве модели для организации информации по другим микроорганизмам, свойства которых могут быть интересны различным пользователям.

Заключение Революция в методах и методологии изучения биологических объектов (секвенирование геномов и белков, синтетическая и системная биология и т.д.) свидетельствует, что в ближайшие годы поток биологических образцов, подлежащих безусловному сохранению в биологических коллекциях с целью дальнейшего использования в фундаментальных и прикладных исследованиях лавинообразно возрастет. Разработка информационных баз данных, аккумуляция в них сведений разнопланового характера о поддерживаемых штаммах микроорганизмов, в том числе и грибов, и организация их сетевого взаимодействия с важнейшими международными информационными ресурсами, становятся одним из важнейших элементов деятельности.

В современной биологической коллекции имеет также место непрерывная интеграция традиционных видов деятельности и с другими видами деятельности и вопросами, находившимися ранее вне «коллекционной» сферы (доступ к генетическим ресурсам, биобезопасность, регуляция, интеллектуальная собственность, международное право и многие другие). Оперативная деятельность публичных коллекций культур микроорганизмов, к которым относится ВКМ, включает сегодня в качестве основных структурных компонентов следующие направления работы:

длительное гарантированное сохранение поддерживаемого фонда (в нарастающем объеме);

предоставление аутентичных культур и информации о них заинтересованным пользователям;

обеспечение соответствия национальным и международным правилам по биобезопасности, включая процессы обмена культурами и их транспортировки;

анализ и обобщение данных о поддерживаемых культурах и ряд других.

В представленной работе обобщены результаты многолетних исследований, касающихся различных направлений коллекционной деятельности (экспериментального, научно-аналитического и научно-информационного характера).

Получен комплекс новых научных данных, в их числе:

- результаты оценки сроков сохранения жизнеспособности грибов при использовании различных методов консервации (по опыту сохранения фонда грибов ВКМ), - результаты оценки таксономического разнообразия мирового коллекционного фонда грибов (более тысяч видов и внутривидовых таксонов согласно каталогам и другим доступным источникам информации по 662 публичным и исследовательским коллекциям мира, что составляет 5,26 % от числа известных грибных наименований), - степень охарактеризованности грибов молекулярно-генетическими методами (всего 3768 родов и менее 23 тысяч видов по данным, представленных в GenBank;

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/). Установлено, что численность условно патогенных и патогенных грибов превышает 15000 (по официальным документам ВОЗ и разных стран мира).

На основе результатов проведенных экспериментальных и научно-аналитических исследований разработана информационно-справочная система по штаммам грибов и сопряженной информации по таксономии, номенклатуре, биобезопасности, биотехнологии. Справочная система работает в открытом доступе на сайте ВКМ.

Выводы Впервые оценено таксономическое разнообразие реального фонда грибов, поддерживаемого в коллекциях мира, в сравнении с таксономическим разнообразием грибов в генетическом банке (GenBank).

Разработана информационно-справочная система по грибам в коллекциях мира на основе базы данных FungalDC, с предоставлением к ней свободного доступа в режиме он-лайн на сайте ВКМ (www.vkm.ru). Непосредственно со страниц ВЕБ-сайта ВКМ организован быстрый и точный переход к основным информационным ресурсам по грибам – WDCM, Index Fungorum, MycoBank, GenBank и StrainInfo, предоставивший пользователям возможность получать максимальный объем сведений по конкретным видам грибов.

Проведен анализ и обобщение сведений по патогенным и условно-патогенным видам грибов, которые включены в официальные документы по проблемам биобезопасности Всемирной организации здравоохранения и разных стран мира.

Выявлена необходимость приведения правил и рекомендаций по работе с патогенными и условно-патогенными видами грибов в РФ в соответствие с современным уровнем развития науки и и их гармонизации с релевантными документами по биобезопасности стран-участниц ВТО.

Получены экспериментальные данные по срокам длительного (более 40 лет) гарантированного сохранения различными методами жизнеспособности штаммов более 1220 видов из фонда мицелиальных грибов Всероссийской коллекции микроорганизмов.

Проведен анализ разнообразия вторичных метаболитов (более 20 классов органических соединений), синтезируемых штаммами рода и создана действующая модель специализированной базы данных по поиску штаммов-продуцентов различных микробных метаболитов.

Разработана структура и проведено наполнение информационн-справочной системы для сопровождения оперативной коллекционной деятельности по поддержанию фонда мицелиальных грибов ВКМ, позволяющей вести поиск нужных штаммов и информации о них в режиме on-line.

Публикации.

Статьи в рецензируемых российских журналах и главы в монографиях и учебных пособиях 1 Мирчинк Т.Г., Озерская С.М., Кочкина Г.А. Фенолоксидазная активность микромицетов подстилок и почв // Биологические науки. 1984. №12. С.88-90.

2 Озерская С.М., Скворцова М.М., Кочкина Г.А., Дрягина Т.Н., Афонина Е.В. Активация прорастания покоящихся спор Entomophthora thaxteriana Petch // Микология и фитопатология. 1986. Т.20. Вып.4. С.175-178.

3 Запрометова О.М., Озерская С.М., Улезло И.В. Активность некоторых специфических гликозидаз микроскопических грибов почвы и подстилки // Микология и фитопатология.

1987. Т.21. Вып.2. С.148-151.

4 Мацкевич Н.В., Денбновецкий Г.Ю., Семашко А.Ю., Налепина Л.Н., Озерская С.М., Бурова Л.Г., Соломахина В.М. Научно-методические указания по изучению и охране редких и находящихся под угрозой исчезновения видов грибов-макромицетов. М.: ВНИИ Охраны природы. 1989. 35с.

5 Виды мицелиальных и дрожжевых грибов, поддерживаемых в коллекциях Болгарии, Вьетнама, Монголии, СССР, Чехословакии / Озерская С.М., Голубев В.И., Кочкина Г.А. и др. // Биотехнология, биотехника, biotechnology. Болгария. 1990. № 5-6.

6 Озерская С.М., Иванушкина Н.Е. Международная комиссия по таксономии грибов.

Элементы кодекса номенклатуры в практике микологов-систематиков // Микология и фитопатология. 1991. Т.25. Вып.3. С.260-263.

7 Каталог культур микроорганизмов. Раздел "Мицелиальные грибы" / Озерская С.М., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Запрометова К.М., Еремина С.С. (Ред. Л.В.Калакуцкий, М.В.Фатеева). М.: Изд-во ВИНИТИ. 1992. С.93-164.

8 Озерская С.М., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е. Информационная база данных о штаммах мицелиальных грибов // Микробиология. 1995. Т.64. №4. С.5-9.

9 Калакуцкий Л.В., Озерская С.М., Евтушенко Л.И., Мазанов А.Л. Российские коллекции микроорганизмов // Прикладная биохимия и микробиология. 1996. Т. 32. №1. С.144-154.

10 Коваленко А.Е., Нездойминого Э.Л., Мацкевич Н.В., Афанасьева М.М., Лутков А.И., Семашко А.Ю., Иванов А.И., Озерская С.М. Программа концептуальной модели банка региональных данных по редким видам грибов. ВНИИ Охраны природы / Деп. в ВИНИТИ № 3684-B96 от 09.12.1996/. 13c.

11 Мацкевич Н.В., Денбновецкий Г.Ю., Мамедова Э.Т., Семашко А.Ю., Лутков А.А., Кучерявая О.А., Новак О.Г., Озерская С.М., Налепина Л.Н., Кобякова Т.Е., Клипцов С.В.

Научно-методические указания по криоконсервации редких макромицетов и папоротниковидных с использованием морфологического и цитологического тестирования.

ВНИИ Охраны природы / Деп. в ВИНИТИ № 3771-B96 от 17.12.1996/. 20c.

12 Озерская С.М. Рецензия на сборник "Биоразнообразие микроорганизмов: роль центров микробных ресурсов" (The Biodiversity of Microorganisms and the Role of Microbial Resource Centres / Ed.: B.Kirsop, D.L.Hawksworth on behalf of the WFCC Bidiversity Committee. World Federation for Culture Collections. UNEP, UK, 1994. 104p.) // Микология и фитопатология.

1996. Т.30. Вып.5-6. С.81-84.

13 Озерская С.М. Рецензия на сборник "Международные руководящие принципы техники безопасности ЮНЕП в области биотехнологии". Программа Организации Объединенных Наций по окружающей среде, 1996. 39с. // Микробиология. 1996. Т.66. №6. С.863-864.

14 Фонин В.С., Сидякина Т.М., Шаин С.С., Озерская С.М., Павлова Е.Ф. Изучение условий хранения промышленных штаммов паразитарной культуры спорыньи // Прикладная биохимия и микробиология. 1996. Т.32. №4. С.406-410.

15 Воронина Э.Г., Мукомолова Т.Ю., Васильев С.В., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Токсические метаболиты коллекционных культур энтомофторовых грибов и первичный отбор активных моноконидиальных изолятов Entomophthora thaxteriana Petch. (Zygomycetes, Entomophthorales) // Микология и фитопатология. 1997. Т.31. Вып.2. С.42-53.

16 Иванушкина Н.Е., Еремина С.С., Кочкина Г.А., Запрометова К.М., Озерская С.М. Влияние бифоназола на мицелиальные грибы разных систематических групп // Вестник дерматологии и венерологии. 1997. №4. С.8-9.

17 Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Транспортировка потенциально опасных культур грибов // Микология и фитопатология. 1997. Т.31. Вып.4. С.62-71.

18 Козловский А.Г., Винокурова Н.Г., Желифонова В.П., Озерская С.М. Исследование алкалоидообразования у грибов рода Penicillium серий Fellutana и Canescentia // Микробиология. 1997. Т.66. №4. С.514-519.

19 Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Озерская С.М. Проблемы безопасности при работе с мицелиальными грибами // Вестник дерматологии и венерологии. 1997. №4. С.16-20.

20 Козловский А.Г., Винокурова Н.Г., Озерская С.М. Особенности алкалоидообразования у штаммов Penicillium chrysogenum, выделенных из почв различных климатических зон // Микробиология. 1998. Т.67. №4. С.483-487.

21 Озерская С.М., Кочкина Г.А. (Перевод). Будапештский договор: Практический кодекс для международных органов по депонированию (The Budapest Treaty: Code of Practice for IDAs / Ed.: M.Bosschaerts. BCCM, Belgium, 1998. 24p.) // Микробиология. 1999. Т.68. № 3. С.423 430.

22 Шабаева Э.В., Яшина С.Г., Еремина C.C., Озерская C.М. Опыт культивирования мицелия базидиальных грибов на средах для выращивания тканей растений // Цитология. 1999. №3-4.

С.323-324.

23 Винокурова Н. Г., Озерская С.М., Желифонова В. П., Аданин В.М. Таксономическое положение и азотсодержащие вторичные метаболиты Penicillium vitale Pidoplichko et Bilai apud Bilai // Микробиология. 2000. Т.69. №3. С.415-419.

24 Козловский А.Г., Желифонова В.П., Винокурова Н.Г., Озерская С.М. Влияние микроэлементов на биосинтез метаболитов грибом Penicillium citrinum Thom ВКМ F-1079 // Микробиология. 2000. Т.69. №5. С.642-646.

25 Винокурова Н. Г., Озерская С.М., Баскунов Б.П., Аринбасаров М.У. Грибы Penicillium commune Thom и Penicillium clavigerum Demelius - продуценты фумигаклавинов А и Б // Микробиология. 2003. Т.72. №2. С.180-182.

26 Козловский А.Г., Желифонова В.П., Аданин В.М., Антипова Т.В., Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Грефе У. Выделенные из вечной мерзлоты грибы вида Penicillium aurantiogriseum Dierckx 1901 - продуценты дикетопиперазиновых алкалоидов рокефортина и 3,12-дигидрокефортина // Прикл. биохимия и микробиология. 2003. Т.39. №4. С.446-451.

27 Шабаева Э.В., Яшина С.Г., Еремина C.C., Озерская C.М., Левицкая Г.Е., Егорова Е.Ф., Гахова Э.Н. О сохранении генофонда базидиальных грибов Приокско-Террасного заповедника // Микология и фитопатология. 2004. Т.38. Вып.3. С.59-65.

28 Озерская С.М., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Запрометова К.М., Еремина С.С.

Мицелиальные грибы во Всероссийской коллекции микроорганизмов (ВКМ ИБФМ РАН) // Прикл. биохимия и микробиология. 2005. Т.41. №5. С.596-600.

29 Белова Н.В, Псурцева Н.В., Гачкова Е.Ю., Озерская С.М. Сохранение разнообразия базидиомицетов ex situ в специализированной коллекции культур ЛЕ (БИН) // Микология и фитопатология. 2005. Т.39. Вып.2. С.1-10.

30 Винокурова Н.Г., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А., Аринбасаров М.У., Озерская С.М. Синтез микофеноловой кислоты грибами рода Penicillium Link // Прикл. биохимия и микробиология. 2005. Т.41. №1. С.95-98.

31 Озерская С.М., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Запрометова К.М., Еремина С.С., Князева Е.В. Состояние коллекций микроорганизмов в России // Вестник биотехнологии и физико химической биологии им. Ю.А.Овчинникова. 2006. Т.2. №3. С.51-61.

32 Желифонова В.П., Антипова Т.В., Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Козловский А.Г. Грибы Penicillium variabile Sopp 1912, выделенные из многолетнемерзлых древних отложений, как продуценты ругуловазинов // Микробиология. 2006. Т.75. №6. С.742-746.

33 Буркин А.А., Кононенко Г.П., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Иммуноферментный анализ PR токсина в таксономической оценке грибов рода Penicillium Link // Прикл. биохимия и микробиология. 2007. Т.43. №4. С.505-510.

34 Кураков А.В., Новикова Н.Д., Озерская С.М., Дешевая Е.А., Геворкян С.А., Гогинян В.Б.

Условно-патогенные и токсигенные микроскопические грибы среди деструкторов синтетических полимерных материалов // Авиакосмическая и экологическая медицина.

2007. Т.41. №5. С.49-55.

35 Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А. Патогенные грибы: категоризация биологического риска и разнообразие / В сб. "Микология сегодня" / Ред. Ю.Т.Дьяков, Ю.В.Сергеев. М.: Национальная академия микологии, 2007. С.268-282.

36 Озерская С.М., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Князева Е.В., Гиличинский Д.А. Структура комплексов микромицетов в многолетнемерзлых грунтах и криопэгах Арктики // Микробиология. 2008. Т.77. №4. С.542-550.

37 Кураков А.В., Геворкян С.А., Гогинян В.Б., Озерская С.М. Разнообразие и особенности состава микроскопических грибов на синтетических полимерных материалах // Прикл.

микробиология и биохимия. 2008. Т.44. №2. С.232-235.

38 Озерская С.М. Рецензия на сборник «Руководства ОЭСР для биологических ресурсных центров с учетом наилучшей практики» (OECD Best Practice Guidelines for Biological Resource Centres. OECD, 2007, 115p.) // Прикл. биохимия и микробиология. 2008. Т.44. №5.

С.615-616.

39 Желифонова В.П., Антипова Т.В., Озерская С.М., Кочкина Г. А., Козловский А.Г.

Вторичные метаболиты грибов рода Penicillium, выделенных из многолетней мерзлоты, как хемотаксономические маркеры // Микробиология. 2009. Т.78. №3. С.393-398.

40 Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А., Еремина С.С., Озерская С.М. Опыт использования современных методов длительного хранения грибов в ВКМ // Микология и фитопатология.

2010. Т.44. Вып.1. С.19-30.

41 Антипова Т.В.,Желифонова В.П., Баскунов Б.П., Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Козловский А Г. Новые продуценты биологически активных соединений грибы рода Penicillium, выделенные из отложений вечной мерзлоты // Прикл. биохимия и микробиология. 2011. Т.47. №3. С.318-323.

42 Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А. Микроскопические грибы в связи с проблемами биологической безопасности // Проблемы медицинской микологии. 2011. Т.13.

№3. С.3-12.

43 Калакуцкий Л.В., Озерская С.М. Биологические ресурсные центры: современное состояние в России и мире, проблемы организации, перспективы развития // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии им. Ю.А.Овчинникова. 2011. Т.7. №1. С.28-40.

44 Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А. Таксономическое разнообразие патогенных и условно-патогенных грибов / Елинов Н.П., Васильева Н.В., Маметьева А.А., Николенко М.В., Озерская С.М. Патогенные и условно-патогенные макро- и микромицеты как объекты царства грибов (Fungi), их характеристика с учётом требований международного кодекса ботанической номенклатуры. Вып. I. Учебное пособие. Санкт-Петербург, 2011. Глава 13.

С.44-49.

45 Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А. Разнообразие грибов третьей (III) и четвёртой (IV) групп патогенности, соответствующих уровням риска BSL-2 и BSL-1 / Елинов Н.П., Васильева Н.В., Маметьева А.А., Николенко М.В., Озерская С.М. Патогенные и условно-патогенные макро- и микромицеты как объекты царства грибов (Fungi), их характеристика с учётом требований международного кодекса ботанической номенклатуры.

Вып. I. Учебное пособие. Санкт-Петербург, 2011. Глава 14. С.50-60.

46 Козловский А.Г., Желифонова В.П., Антипова Т.В., Баскунов Б.П., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Профили вторичных метаболитов грибов подрода Penicillium рода Penicillium, выделенных из вечномерзлых отложений, как элементы полифазной таксономии // Микробиология. 2012. Т.81. №3. С.332-338.

Статьи в зарубежных изданиях 47 Vasilenko A.N., Ozerskaya S.M. Package for Cluster Analysis on an IBM PC Computer // BINARY. 1992. V.4. P.64-65.

48 Vasilenko A.N., Ozerskaya S.M. Quick Algorithms of Cluster Analysis in BIOMATRIX 3.0 // BINARY. 1994. V.6. P.141-144.

49 Kozlovsky A.G., Zhelifonova V.P., Ozerskaya S.M., Vinokurova N.G., Adanin V.M., Grafe U.

Cyclocitrinol, a new fungal metabolite from Penicillium citrinum // Pharmazie. 2000. V.55. N.6.

P.470-471.

50 Kozlovsky A.G., Zhelifonova V.P., Adanin V.M., Ozerskaya S.M., Grafe U. Nosporins A and B, new metabolites from a filamentous fungus, VKM F-3750 // Pharmazie. 2003. V.58. N.1. P.76-77.

51 Kozlovsky A.G., Zhelifonova V.P., Antipova T.V., Adanin V.M., Ozerskaya S.M., Ivanushkina N.E., Gollmick F.A., Grfe U. A new N-carboxylester derivative of 3,12-dihydroroquefortine // Heterocycles. 2003. V.60. N.7. P.1639-1644.

52 Ozerskaya S.M., Vasilenko A.N, Verslyppe B., Dawyndt P. FungalDC: a database on fungal diversity in culture collections of the world // Inoculum. Supplement to Mycologia (Newsletter of the Mycological Society of America). 2010. V.61. N.3. P.1-5.

53 Ozerskaya S.M., Kochkina G.A., Ivanushkina N.E. Fungal diversity in GenBank: problems and possible solutions // Inoculum. Supplement to Mycologia (Newsletter of the Mycological Society of America). 2010. V.61. N.4. P.1-4.

54 Vasilenko A., Ozerskaya S., Stupar O. Current WFCC CC catalogues as a starting ground for networking efforts // WFCC Newsletter. 2011. N.50. P.5-15.

55 Ozerskaya S.M. Fungal diversity in Genbank. McGraw-Hill Yearbook of Science and Technology 2012. McGraw-Hill Professional, NY, 2012. P.99-103.

56 Ozerskaya S.M., Ivanushkina N.E., Kochkina G.A., Eremina S.S., Vasilenko A.N., ChiginevaN.I.

Long Term Preservation of Fungal Cultures in All-Russian Collection of Microorganisms (VKM):

Protocols and Results / In: «Laboratory protocols in fungal biology: current methods in fungal biology» / Eds. Gupta V.K., Tuohy M., Manimaran A., Turner K.M., O’Donovan A.) Springer, New York, 2012 (In Press).

57 Vasilenko A.N., Ozerskaya S.M. Fungal taxonomic diversity and bioinformatics-related issues / Proceedings of the 6th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE 2012). 2012. - NY. - IEEE Service Center. - P. 633-634.

58 Ozerskaya S.M., Kirillova N.P., Vasilenko A.N. FungalDC: a database on fungal diversity in genetic resource collections // IMA Fungus. 2012. V.3. N.1. P.9.

Свидетельства о Государственной регистрации 59 Озерская С.М., Кочкина Г.А., Василенко А.Н., Максимова Л.А., Иванушкина Н.Е. FungalDC - Разнообразие грибов в коллекциях культур. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2010620603. Зарегистрировано в Реестре баз данных 13.10.2010.

60 Озерская С.М., Кочкина Г. А., Василенко А.Н., Чигинева Н.И., Иванушкина Н.Е., Карпышева Н.Н., Кириллова Н.П., Растегаева Т.Ф. База данных: Фонд мицелиальных грибов Всероссийской коллекции микроорганизмов ИБФМ РАН. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2011620277. Зарегистрировано в Реестре баз данных 14.04.2011.

Соискатель С.М.Озерская

Pages:     | 1 ||
 




 
2013 www.netess.ru - «Бесплатная библиотека авторефератов кандидатских и докторских диссертаций»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.